根據前阿富汗政府外交發言人 Murwaiz Balkh 的說法，伊斯蘭國（ISIS）之所以能在阿富汗境內在短期內迅速紮根，是因為伊斯蘭國和塔利班相較起來，更能確保經濟獨立，而且招募的人力大多數為曾受過教育的程度，並且在一些政策上有更為務實的態度，伊斯蘭國在阿富汗境內創建的恐怖組織體系更加有效率的運作，也更積極使用現代網路的工具。
同時伊斯蘭國的 70% 資金都來自於國外的贊助，許多觀察員都談到伊斯蘭國令人印象深刻的後勤供應鏈的高度完整性，前阿富汗政府下議院副議長曾說過，伊斯蘭國除了戰車和直升機，其他要有的幾乎都有。由於金主和意識形態，意味著伊斯蘭國不是地區威脅，而是成為全球威脅，這已經超越了塔利班所帶來的威脅，因為伊斯蘭國想要藉此拿塔利班作為跳板。
2016 年 10 月，阿富汗當時的第一副總統杜斯坦（Abdul Rashid Dostum）表示，他收到情報顯示伊斯蘭國正在計劃於 2017 年春季之前把數千名武裝分子從伊拉克和敘利亞移動到阿富汗北部。他强調，這些人主要來自塔吉克、烏茲別克、吉爾吉斯和北高加索地區的人。因此可以説明，來自國外的兵力在伊斯蘭國對阿富汗北部和東部的滲透已發揮了重要作用。尤其是阿富汗的在昆都士省，前省長 Mohammad Omar Safi 曾經表示，來自塔吉克、烏茲別克、吉爾吉斯、土耳其和北高加索地區的武裝分子是檯面上最爲活躍的一群人。
目前，伊斯蘭國對阿富汗和中亞的興趣越來越大，這與伊斯蘭國在敘利亞和伊拉克的失敗有關。其實正因為阿富汗局勢不穩定，伊斯蘭國才有這個機會。
俄國總統蒲亭的阿富汗問題特別代表卡布洛夫（Замир Набиевич Кабулов）曾表示，在阿富汗北部的幾個省份已建立了與各種國際恐怖組織有關聯的武裝分子的培訓中心，並屬於塔利班、伊斯蘭國、蓋達（又稱基地組織）、各種族群（來自中亞的移民、維吾爾人、白種人、阿拉伯人）。
然後也有報導表示，塔利班的白旗有時候會被一些部隊定期替換為伊斯蘭國的黑旗，相互交叉。而且國旗的更替速度取決於各種市場因素，比如來自外部的一些贊助商的資金或其他短期政治利益。
因伊斯蘭國的意識形態和蓋達組織極為接近，所以這些武裝團體皆對俄羅斯的中亞後花園造成了嚴重的安全威脅。這是俄羅斯外交在面對阿富汗時遇到的問題。此外，阿富汗政府也把伊斯蘭國在阿富汗北部的利益與俄羅斯空軍在敘利亞的行動視為是相關聯的。
在伊朗的幫助下，阿富汗什葉派哈扎拉人（Hazāra）組建了一支高水準的民兵作戰組織，叫做法蒂瑪旅 (Фатимиюн)。法蒂瑪旅是敘利亞內戰中一個在 2014 年建立的親政府民兵組織，由伊朗政府招募的阿富汗什葉派穆斯林組成，協助敘利亞政府對抗反政府武裝。法蒂瑪旅由伊朗伊斯蘭革命衛隊訓練及提供資金和裝備，並由伊朗軍官指揮作戰。據報法蒂瑪旅在 2016 年 6 月的兵力有 12,000－14,000 人。
而這個有實戰經驗的作戰部隊可以用來對抗塔利班，因為哈扎拉人對在塔利班統治内，什葉派曾遭受的恐怖清洗有著非常深刻的仇恨記憶。塔利班過去在與美國人交戰時，有時候也會混搭伊斯蘭國，經常在阿富汗和巴基斯坦組織針對什葉派的恐怖襲擊。因此，在波斯灣金主的資金不斷流入阿富汗境内的狀況下，中東的遜尼派與什葉派的衝突很容易蔓延到阿富汗境内。
阿富汗目前還有種族之間對抗的問題，如果局勢不穩定，塔利班將會和重組的北方聯盟發生新的戰爭，在這樣的情況下，不同的種族會找不同的勢力來尋求幫助，例如普什圖人可能會去找巴基斯坦，也可能去中國、美國或波斯灣國家；哈扎拉人到伊朗；塔吉克人找塔吉克、俄羅斯、印度；烏茲別克人找烏茲別克、土耳其和俄羅斯。值得注意的是，在 90 年代的時候這種事情已經發生過一次，那時候正逢普什圖人和塔吉克聖戰者之間，以及塔利班和北方聯盟之間的內戰的時候。