目前，根據指揮中心每天召開的記者會，可以看到台灣每天出現數百例本土病例，以及自上禮拜六出現的「校正回歸」數據，因此，現在的台灣除了關心三級警戒和疫情情況，更重要的是「疫苗」問題，尤其是面對疫苗是否能由地方自行進口，地方與中央產生不同的看法，指揮中心今（25）日表示：整體疫苗的「戰略」是由中央疫情指揮中心負責。
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昨（24）日，新黨為金門被中央撤銷快篩站抱不平，新黨黨主席吳成典還說，他先前已經跟大陸聯繫，大陸願意提供十萬劑免費的國產疫苗給金門縣全體縣民施打。金門縣除表示早已致函中央讓地方設置快篩站外，也希望請中央支持金門防疫作為及核准疫苗進口，金門縣政府也沒有說和哪個廠商購買疫苗，只說：「更會在最快時間內，委託合法廠商，提出進口疫苗的要求，屆時，請中央依程序儘速審核通過，勿再以任何理由阻擋。」其實不只金門有意自行進口疫苗，南投縣長林明溱昨也透露，中國浙江省國台辦曾與南投縣表示，願意協助採購 30 萬劑疫苗。
中國國台辦面對台灣有人呼籲進口中國疫苗，國台辦發言人昨日也表示，他們願意迅速作出安排，讓廣大台灣同胞盡快有大陸疫苗可用。如果有需要，他們也願意積極考慮向台灣派出疫情防控專家，與台灣醫療衛生人士分享抗疫經驗，提供防疫咨詢。
今（25）日，指揮中心除報告今天總計 283 病例，其中本土 281 例，境外 2 例，校正回歸 261例外，指揮中心也宣布，評估台灣疫情，決議將全國「三級警戒」延至 6 月 14 日。
在記者會上，有記者問到，昨日金門縣政府強調兩度發函中央可以委託合法的廠商進口疫苗，南投也希望自從 2000 萬採購 30 萬的疫苗，因為他們提到離島的醫療量能不足，如果沒有積極防疫可能會衝擊離島的防疫，中央一直「已讀不回」，中央是不是能夠開放地方自行採購疫苗，或是給予何種防疫協助？
指揮中心副指揮官陳宗彥回應，指揮中心業務組並沒有接到金門與南投有關於疫苗來文。指揮中心指揮官陳時中也再三強調，疫苗整體的程序相當複雜，整體疫苗的「戰略」是由中央疫情指揮中心負責，如有任何訊息都可以提供給他們，指揮中心會加以研判。
資料來源：新黨 金門縣政府 國台辦 指揮中心記者會