快篩試劑成為現今台灣重要的防疫資源，但也成為目前政治攻防的新戰場，日前柯文哲稱刪除 28 億快篩預算，是因為「太相信中央」，指揮中心回覆表示，台北市申請 12 萬，指揮中心給北市府 73 萬，北市府發言人陳智菡表示，中央配送仍未到貨，然而柯文哲所稱「太相信中央」說，卻被議員簡舒培拿出公文表示柯文哲說謊，今（9）日，指揮中心針對未送達 73 萬快篩澄清表示，早就與北市府溝通確認分配快篩。
柯文哲相關新聞：柯文哲要醫院且戰且走 北市聯醫工會：我們已經太累了！
台北市長柯文哲表示，當時議會曾向他表示要刪除 28 億防疫用品預算，7 日受訪時柯文哲表示這是錯誤的決定，說當時「太相信中央的話」，陳時中表示，現在台北市申請 12 萬快篩，指揮中心要給北市 73 萬快篩，也不用他買。台北市發言人陳智菡對此回應說到，中央應配送公費快篩未配發到貨。
不過，柯文哲所稱「太相信中央」刪除快篩預算，被台北市議員簡舒培痛批說謊，簡舒培拿出公文強調：
從簡舒培的證據顯示：柯文哲此舉根本沒有要買快篩的意願，此外，台北市議員梁文傑今日拿出審計部的資料表示， 1 月到 4 月北市編列購買快篩的預算只有 53 萬，比金門縣政府 69 萬還少。
梁文傑強調，台北市政府不是沒有錢，想買的話，隨時可以從市長預備金、災害準備金和疫情募款調個幾億出來，問題是柯文哲從來沒有把買快篩當成重要事項，因為他很久以前就說打了三劑就要和病毒共存，很多措施可以拿掉，然後疫情起來，又最先呼籲要以篩代隔，好像自己是先知。等到被人發現其實台北市從來沒有把買快篩當一回事，又說是因為「聽信中央的話」。
另外，台北市政府幫副市長黃珊珊出版新書《堅韌的疫誌 台北市防疫紀實》，被簡舒培質疑，柯文哲沒錢買快篩，卻可以幫副市長編列 153 萬預算「大內宣」。
對於北市稱 73 萬快篩試劑尚未到貨，指揮中心發言人莊人祥今日表示，中央與各縣市聯絡，都要確認大概何時要下多少的貨，經過同仁與市府聯繫，已在 5 月 6 日用電子郵件通知，各縣市都回報他們要在何地、何時來接受快篩試劑。
莊人祥強調，因此，台北市府在 5 月 9 日、5 月 11 日和 5 月 13 日分別配送 30 萬、23.5 萬和 19.5 萬劑，指揮中心已和廠商說明何時要送到北市府多少劑的快篩，事實上都有做規劃，也下達指令。
陳時中補充說明，基本上，由於快篩是公費使用，每次會有一定的量，會請地方政府先來評估要多少，請地方政府在 5 月 4 日來回報，並請他們在 5 月 5 日回報地方政府的庫存量還有多少？根據地方政府提供的庫存量，加上中央能供應的量，計算出分配的量， 會在 5 月 6 日通知地方政府送到哪裡去？誰來點收？