黑熊學院院長沈伯洋被納入民進黨不分區立委第二名，引發議論。國防部長邱國正昨（20 日）表示，黑熊學院就像一群有興趣的人到野外打漆彈，並強調建這種部隊會變成游擊隊，除非逼不得已，否則不會列入考慮。對此，黑熊學院昨回應，從未教導民眾打「漆彈」及任何相關射擊訓練，面對謠言非常遺憾，希望邱身為國防部長，不會搞不清楚「民防」與「國防」之間的差異。
有媒體質疑沈伯洋若進國會，國防官員會被灌輸「黑熊化」。對此，邱國正昨在立法院接受媒體聯訪時回應：「我不臆測」！對於黑熊學院是否要納入國軍建制？邱國正指稱，自己是把它當成一個社團，好比一群有興趣的人到野外打漆彈。邱國正強調，國軍是有陸海空軍的，從戰鬥觀念來看，建這種部隊會變成游擊隊，建軍備戰不會建游擊隊的，除非是逼不得已，否則不會考慮。
對此，黑熊學院昨透過臉書發布聲明回應，邱國正身為台灣的國防部長，不至於不清楚「民防」與「國防」之間的差異，更不會與其他有既定立場的媒體或不明事理的聲音一起胡說八道。
黑熊學院澄清，他們從未教導民眾打「漆彈」以及任何相關的射擊訓練，這一點有數萬名學員能夠證明。此外，黑熊學院指出，學員必須在教室上過 8 小時完整的民防觀念、救護技術實作等，才有辦法參與大型演訓，而黑熊學院從未成立「部隊」，過去從未做、今天不會做、未來也不會這麼做。
黑熊學院表示，他們一直希望做的是讓「每一個生活在這塊土地上的台灣人擁有保護自己的能力，再保護自己的親朋好友；他們強調，在戰時醫療資源稀缺，能學會傷口包紮、止血帶使用、骨折固定；提前找到「能夠進去」的避難所並且規劃路線；知道避難包該準備哪些東西。黑熊學院續指，這些內容還有另一件重要目的，那就是「不要成為第一線國軍弟兄的負擔」。
對於邱國正比擬黑熊學院像「漆彈社團」，台灣基進不分區立委參選人陳君愷今（21 日）表示，黑熊學院的宗旨和台灣基進的倡議，一直都是要催促政府加速防衛準備。然而，面對台海局勢的嚴峻挑戰，國防部總是顯得被動，且嚴重準備不足，令人憂心。
陳君愷說，從海島防禦的角度看，台灣理應要在海空封鎖、以及飛彈飽和攻擊的狀況下，讓社會能夠維持正常運作，伺機尋求勝利的機會；而這需要通盤檢討整體架構、徹底重構兵役制度、以及真正建立起全民國防，才有可能達成。陳君愷痛批，國防部長一席話，不知是刻意要貶抑黑熊學院及眾多關心民防的有志之士，還是單純和馬文君一樣無知？
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