武漢肺炎疫情要能得到控制，大規模施打疫苗是重要的關鍵手段，有關「疫苗」的假訊息中，多數乃極力想要降低民眾對於疫苗的信心，藉此降低施打疫苗的意願，只要民眾不願意施打疫苗，且政府無法強制施打之下，即使台灣能夠取得足夠的疫苗，也對疫情的控制無濟於事，這將讓台灣的疫情難以平息。
為因應武漢肺炎疫情，自 2021 年 5 月 15 日後，指揮中心宣布雙北市進入三級警戒，指揮中心也在 5 月 19 日宣布全國進入三級警戒，來因應日趨嚴峻的肺炎疫情。不過，醫療人員第一線對抗武漢肺炎疫情時，網路社群中的假消息仍然不斷流竄，試圖打擊台灣防疫效能、分裂台灣內部團結。
從 5 月 15 日開始檢索疾管署的澄清專區，並且以「疫苗」相關的訊息來看，疾管署所澄清的消息，在 5 月 20 至 5 月 25 日共有五則有關疫苗的假消息：
以上五則假訊息中，有三則是攻擊政府利用疫苗來賺取國難財，例如指摘行政院長蘇貞昌持有國產疫苗之股票來讓閱聽人認為政府官員可以從國產疫苗中漁利，甚至指控政府為了銷售疫苗而刻意讓疫情失控，這個面向的假訊息攻擊，也讓蔡英文總統不得不出面駁斥：「政務人員絕無利用疫苗炒股」。
另外，還有一則假訊息指摘政府不願意購買德國 BNT 疫苗共三千萬劑，但其實並非不願購買，而是受到中國政治施壓，讓德國廠商在即將完成簽約之際，突然要求我方將中文新聞稿中的「我國」改為「台灣」，且即使我方修改新聞稿內容後，仍就以「必須重新考量疫苗供給量」為藉口，拖延至今都無法完成簽約。這則假訊息，恐怕是為了塑造中央政府罔顧人命而未積極採購疫苗的負面形象。
最後，則是攻擊我國目前採購的疫苗中含有汞和鋁，打多了可能會造成人體損害，指揮中心在澄清時也指出，這則假訊息應是境外不明人士刻意散播，企圖要擾亂我國的防疫工作，降低民眾施打疫苗的意願，進而造成我國疫情無法控制。
另外，從台灣事實查核中心上，從 5 月 15 日開始檢索有關疫苗的假訊息，共有四則假訊息，其中有兩則是這兩日經事實查核中心證實為虛假訊息：
以上四則假訊息中，前兩則假訊息都是在我國收到四十萬劑輝瑞與十五萬劑莫德納疫苗之後，所放出來的假訊息，一則是攻擊 AZ 疫苗根本就是韓國政府不要的次等品，藉此來讓閱聽人對 AZ 疫苗的效果產生疑慮，降低國人施打疫苗的意願；第二則假訊息也循類似概念，影射台灣收到的莫德納疫苗是「假貨」，試圖讓國人不相信疫苗成效，降低施打疫苗意願。
第三則比較特別，它是某位網紅在臉書貼文上，似乎試圖要為國產疫苗背書，以提升國人對國產疫苗的信心，在貼文中說到「高端疫苗跟莫德納系出同門」等語，不過事實查核中心的查核報告中指出，兩種疫苗雖然取得同一抗原，但是兩種疫苗使用的技術仍不相同，兩者不能等同。
第四則訊息一樣是要打擊國人對於國產疫苗的觀感與信心，內容謊稱國產疫苗的實驗進度緩慢，才剛剛完成人體實現，根本不可能來得及上市施打。藉此將讓民眾對於疫苗失去信心，進而對於疫情產生恐慌，而且一樣也會讓民眾不敢施打國產疫苗，認為國產疫苗是倉促上市而有許多風險。
從本文上開分析來看，針對「疫苗」進行攻擊之假訊息，其目標相當一致，就是要想方設法打擊國人對於疫苗的信心，無論是國產疫苗還是進口疫苗，都希望國人對「疫苗」有所恐懼而不願意施打；另外則是攻擊政府人員從疫情中漁利，根本無心防疫只想發國難財，這樣的觀感一但在民眾之間形成，就會讓人民懷疑政府的種種防疫措施，進而產生疑慮、不願配合。
當然，並不是所有對於疫苗政策的批評與討論，就是一種認知作戰，畢竟批評任何政策都是言論自由所保障的範疇。然而利用疫苗的假訊息，藉此製造恐懼、造成人與人相互的不信任或衝突，形成政府無能的既定印象，疫苗假訊息即達成了它的最終目的。
本文從「疫苗」為中心進行檢索，發現諸多假訊息都是為了打擊國人對疫苗的信心，只要人民不願意配合施打疫苗，那麼台灣的疫情就難以受到控制，即使台灣能夠取得再多的疫苗也失去意義。以此來看，境外勢力對台灣的攻擊中，除了讓台灣在國際上難以取得疫苗之外，也設法讓台灣即使有了充足疫苗，人民也不願施打疫苗，如此一來台灣的疫情就難以控制，使得境外勢力取得更多戰略空間。