近日，促進轉型正義委員會（以下簡稱促轉會）向中國國民黨與政治大學要求繳交「國民黨台灣省黨部文件系列檔案」，遭國民黨質疑促轉會威權復辟、政大則表示這以批與國民黨的合作協議為由拒絕繳交，對此指控，今（28）日，促轉會發一篇新聞稿駁斥此種說法外，指出，要求交出「國民黨台灣省黨部文件系列檔案」 除是依法調查外，且是刻不容緩。
促轉會指出四項重點：
- 國民黨台灣省黨部文件系列檔案並非僅是內部文書。
- 國民黨通報不實，有隱匿檔案之虞。
- 促轉會依法調查省黨部文件系列檔案，國民黨及政大應依法配合。
- 政黨持有政治檔案之調查與審定，刻不容緩。
國民黨雖稱「國民黨台灣省黨部文件系列檔案」是單純內部文件，促轉會初步調查後發現其牽涉黨國時期重大政治案件、黨產與未公開資料等，並非單純內部文件，更牽涉促轉條例所規定應移歸為國家檔案之政治檔案，因此，促轉會依照促轉條例第 14 條要求國民黨和政大繳交檔案。
促轉會表示，知政大與國民黨早已簽訂「黨史資料委託管理合作協議書」，其中包含「國民黨台灣省黨部文件系列檔案」，早已請函兩方瞭解搬遷情形及相關規劃，促轉會提到，當初雙方表示託管標的尚未確認，亦無具體期程規劃，故促轉會希望如有搬運作業啟動時，須告知促轉會並提供相關資料，不料，雙方都未主動回覆後續，促轉會指出「且該批檔案始終未在國民黨通報持有政治檔案清冊之列，國民黨有通報不實之情形。 」促轉會提到，今年 7 月已函請國民黨補正通報，惟國民黨仍函復「並無其餘檔案可通報」。促轉會並於今年發現，國民黨已將未通報之「省黨部檔案」自行搬遷至政大，且有再行搬遷之規劃。
基於上述事實認知，對國民黨通報不實、隱匿當案之疑慮和怕搬運檔案至政大會有毀損，促轉會進一步提出，已於近日拜訪學校，希望校方配合進行政治檔案審定作業，提出確保可於現地保全檔案原件、就地封存等調查、或至少由校方保證不讓國民黨取回，然而校方和國民黨雙方為民間契約為由拒絕。促轉會表示，政大以合作契約書來規避促轉會調查、校方甚至不願配合行政機關依法行使調查權，反要求本會依循一般讀者管道申請閱覽，促轉會認為，促轉會別於一般讀者，促轉會是需透過調查手段取得完整檔案，以審慎進行檔案審定工作。
促轉會強調，站在轉型正義的角度，政黨政治檔案是釐清黨國不分時期不可或缺的重要基礎。促轉會再次重申，政治檔案之審定為促轉會法定職權，此次就台灣省黨部文件系列檔案所為之調查，即是為了審慎完成政治檔案之審定，審定完成後，非屬政治檔案者也將全數歸還國民黨。
促轉會也提到，政黨政治檔案審定完成前，將依法給予陳述意見之機會；審定完成後，國民黨也有申請復查、提起行政訴訟的救濟權利，促轉會表示完全尊重。
根據《促進轉型正義條例》第 14 條：促轉會為完成第十一條第一項及第三項之任務，得以下列行為調查相關事項：
一、通知有關機關（構）、團體、事業或個人到場陳述事實經過或陳述意見。
二、要求有關機關（構）、團體、事業或個人提出檔案冊籍、文件及其他必要之資料或證物。但審判中案件資料之調閱，應經繫屬法院之同意。
三、派員前往有關機關（構）、團體、事業或個人之辦公處所、事務所、營業所或其他場所為必要之調查或勘驗。
四、委託鑑定與委託研究。
五、委託其他機關（構）辦理特定案件或事項。
六、其他必要之調查行為。
各機關接受前項第五款之委託後，應即辦理，並以書面答復辦理結果。促轉會調查人員依法執行職務時，應出示相關證明文件；其未出示者，受調查者得拒絕之。其他關於本條例所定調查之相關事項，由促轉會另以調查程序辦法定之。
